D'abord essentiellement destiné à recouvrir les murs des lieux de culte, l'art de la peinture s'épanouit au fil du Moyen Âge. Avec l'enluminure, elle gagne les pages des manuscrits puis le développement de la peinture sur bois ouvre la voie vers de nouvelles productions, plus raffinées et expressives.
Les collections du musée de Cluny témoignent également de l'histoire du site à travers des œuvres peintes du 19e siècle, qui évoquent les aménagements successifs des lieux.
